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授粉后红球姜雌性生殖器官qRT-PCR的内参基因筛选

林浩川 钟春梅 孙姝兰

林浩川, 钟春梅, 孙姝兰. 授粉后红球姜雌性生殖器官qRT-PCR的内参基因筛选[J]. 华南师范大学学报(自然科学版), 2017, 49(1): 67-73. doi: 10.6054/j.jscnun.2017058
引用本文: 林浩川, 钟春梅, 孙姝兰. 授粉后红球姜雌性生殖器官qRT-PCR的内参基因筛选[J]. 华南师范大学学报(自然科学版), 2017, 49(1): 67-73. doi: 10.6054/j.jscnun.2017058
LIN H C, ZHONG C M, SUN S L. Screening of Reference Genes for qRT-PCR Analysis in Zingiber zerumet (L.) Smith Female Reproductive Organ after Pollination[J]. Journal of South China normal University (Natural Science Edition), 2017, 49(1): 67-73. doi: 10.6054/j.jscnun.2017058
Citation: LIN H C, ZHONG C M, SUN S L. Screening of Reference Genes for qRT-PCR Analysis in Zingiber zerumet (L.) Smith Female Reproductive Organ after Pollination[J]. Journal of South China normal University (Natural Science Edition), 2017, 49(1): 67-73. doi: 10.6054/j.jscnun.2017058

授粉后红球姜雌性生殖器官qRT-PCR的内参基因筛选

doi: 10.6054/j.jscnun.2017058
基金项目: 

国家自然科学基金委员会-广东省人民政府联合基金

详细信息
    通讯作者:

    孙姝兰

  • 中图分类号: Q786

Screening of Reference Genes for qRT-PCR Analysis in Zingiber zerumet (L.) Smith Female Reproductive Organ after Pollination

Funds: 

The National Natural Science Foundation of China Guangdong Joint Fund

  • 摘要: 在研究分析红球姜(Zingiber zerumet (L.) Smith)败育关键调控基因的表达中,筛选授粉后雌性生殖器官发育过程中的内参基因至关重要。本研究根据授粉后不同时间点的红球姜转录组数据库以及相关文献报道的传统内参基因,筛选出10个表达相对稳定的基因Actin-2(ACT2)、Actin-7(ACT7)、Beta tubulin-1(TUB1)、Beta tubulin-5(TUB5)、Alpha tubulin-3(TUA3)、Ubiquitin(UBQ)、Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase(GAPDH)、Elongation factor 1-alpha(EF-1)、Cyclophilin(CYP)、Histone(H2A)作为候选内参基因,采用qRT-PCR技术,结合GeNorm、NormFinder和BestKeeper软件对候选内参基因的表达稳定性进行分析。结果表明,在红球姜雌性生殖器官授粉后的发育过程中,GAPDH和UBQ的表达稳定性最好,均适合作为内参基因,且同时使用两种作为内参基因能使实时荧光定量PCR标准化分析结果更精确。因此,最终选择GAPDH和UBQ作为实时荧光定量PCR标准化分析红球姜雌性生殖器官相关基因表达的内参基因。本研究将为探究红球姜败育的分子机理奠定基础,也为近源姜属植物内参基因的筛选提供线索。
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出版历程
  • 收稿日期:  2016-10-25
  • 修回日期:  2016-12-02
  • 刊出日期:  2017-02-25

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